1.国家重点研发计划“数字诊疗装备”专项，随机光学重建-结构光照明复合显微成像系统研制，2017.7-2021.12，项目负责人，经费2559万元
2.国家自然科学基金委面上项目，单分子荧光轴向纳米定位及三维超分辨成像技术研究，2015.1-2018.12，项目负责人，经费79万元
3.江苏省重点研发计划项目，基于荧光原位杂交三维定量成像的肿瘤分子病理诊断方法研究，2020.12-2023.7，项目负责人，经费200万元
4.苏州市基础研究试点专项，基于光神经网络的计算光学显微成像技术研究，2022.1-2024.12，项目负责人，经费50万元
5.国家重大科研装备研制项目，超分辨显微光学核心器件及系统研制，2014.1-2018.12，支持经费800万，分系统负责人
6.中科院仪器装备项目，非线性结构光照明超分辨显微镜，2015.1-2016.12，支持经费287万，技术负责人
7.中科院仪器装备项目，微小模式生物高速分选及三维成像成像系统，2016.1-2017.12，经费298万元，技术负责人
8.中科院仪器装备项目，基于平面超透镜的多脑区微型双光子成像系统，2017.1-2018.12，经费198万，参与
9.中科院C类先导专项，高精度电磁测量核心技术装备，2020.1-2022.12，经费437万，参与
10.中科院B类先导专项，离体肝脏维持评估与修复再生关键技术，2025.1-2027.12，经费250万，参与